Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CubnQ9JLB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CubnQ9JLB4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CubnQ9JLB4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms