Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace2Q9JL18 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace2Q9JL18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms