Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot9Q9JKY0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms