Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl6ip1Q9JKW0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip1Q9JKW0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms