Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb3Q9JKS4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms