Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nova1Q9JKN6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nova1Q9JKN6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms