Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndufaf3Q9JKL4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms