Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nrip3Q9JJR9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip3Q9JJR9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms