Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc86Q9JJ89 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc86Q9JJ89 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms