Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnip1Q9JJ57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip1Q9JJ57 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip1Q9JJ57 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms