Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ercc6l2Q9JIM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms