Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Tmod3Q9JHJ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tmod3Q9JHJ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tmod3Q9JHJ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Tmod3Q9JHJ0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmod3Q9JHJ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmod3Q9JHJ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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