Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tcirg1Q9JHF5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcirg1Q9JHF5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms