Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cldn12Q9ET43 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms