Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Sp6Q9ESX2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Sp6Q9ESX2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Sp6Q9ESX2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sp6Q9ESX2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Sp6Q9ESX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Sp6Q9ESX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp6Q9ESX2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms