Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Brd4Q9ESU6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Brd4Q9ESU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Brd4Q9ESU6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Brd4Q9ESU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Brd4Q9ESU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms