Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenofQ9ERR7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms