Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sall1Q9ER74 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall1Q9ER74 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall1Q9ER74 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms