Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sil1Q9EPK6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sil1Q9EPK6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms