Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r53Q9EP93 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r53Q9EP93 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms