Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mrpl4Q9DCU6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms