Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cbx6Q9DBY5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms