Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf6Q9DBU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf6Q9DBU5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms