Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smg9Q9DB90 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smg9Q9DB90 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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