Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms