Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB05

Napa, Alpha-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapaQ9DB05 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NapaQ9DB05 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NapaQ9DB05 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapaQ9DB05 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapaQ9DB05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapaQ9DB05 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NapaQ9DB05 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms