Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Asf1bQ9DAP7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms