Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms