Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700018B08RikQ9DA83 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700018B08RikQ9DA83 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms