Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc89Q9DA73 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc89Q9DA73 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc89Q9DA73 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms