Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgf29Q9DA08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sgf29Q9DA08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sgf29Q9DA08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms