Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot8Q9D8X5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot8Q9D8X5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot8Q9D8X5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms