Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtf3c6Q9D8P7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtf3c6Q9D8P7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c6Q9D8P7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms