Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D8N1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms