Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl3Q9D8K3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl3Q9D8K3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms