Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fip1l1Q9D824 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fip1l1Q9D824 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fip1l1Q9D824 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms