Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Capn9Q9D805 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn9Q9D805 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn9Q9D805 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms