Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan17Q9D7W4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan17Q9D7W4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.3 ms