Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2dQ9D7M8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms