Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4cQ9D7F7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms