Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpap3Q9D706 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpap3Q9D706 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms