Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop56Q9D6Z1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop56Q9D6Z1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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