Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23bQ9D662 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23bQ9D662 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms