Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slco6d1Q9D5W6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slco6d1Q9D5W6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slco6d1Q9D5W6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms