Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnbd2Q9D5U8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms