Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Speer4f1Q9D5Q6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Speer4f1Q9D5Q6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms