Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn11Q9D572 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn11Q9D572 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn11Q9D572 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms