Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc7Q9D541 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc7Q9D541 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc7Q9D541 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms