Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ribc2Q9D4Q1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ribc2Q9D4Q1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ribc2Q9D4Q1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ribc2Q9D4Q1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ribc2Q9D4Q1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ribc2Q9D4Q1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms