Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf6Q9D4J7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Phf6Q9D4J7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Phf6Q9D4J7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms